Universal metabolite: icit

Descriptive name:

Isocitrate

Formulae in BiGG models:

C6H5O7

Charges in BiGG models:

-3

icit in BiGG models:

Organism
Model
Compartmentalized BiGG ID
Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655
iJO1366
icit_c
Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655
iAF1260
icit_c
Saccharomyces cerevisiae S288C
iMM904
icit_c
Staphylococcus aureus subsp. aureus N315
iSB619
icit_c
Escherichia coli APEC O1
iAPECO1_1312
icit_c
Saccharomyces cerevisiae S288C
iND750
icit_c
Yersinia pestis CO92
iPC815
icit_c
Shigella flexneri 2a str. 301
iSF_1195
icit_c
Pseudomonas putida KT2440
iJN746
icit_c
Helicobacter pylori 26695
iIT341
icit_c
Mycobacterium tuberculosis H37Rv
iNJ661
icit_c
Escherichia coli BW2952
iBWG_1329
icit_c
Escherichia coli BL21(DE3)
iB21_1397
icit_c
Escherichia coli CFT073
ic_1306
icit_c
Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69
iE2348C_1286
icit_c
Escherichia coli 042
iEC042_1314
icit_c
Escherichia coli 55989
iEC55989_1330
icit_c
Escherichia coli ABU 83972
iECABU_c1320
icit_c
Escherichia coli B str. REL606
iECB_1328
icit_c
Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG'
iECBD_1354
icit_c
Escherichia coli BL21(DE3)
iECD_1391
icit_c
Escherichia coli DH1
iEcDH1_1363
icit_c
Escherichia coli DH1
iECDH1ME8569_1439
icit_c
Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B
iECDH10B_1368
icit_c
Escherichia coli O139:H28 str. E24377A
iEcE24377_1341
icit_c
Escherichia coli ED1a
iECED1_1282
icit_c
Escherichia coli O157:H7 str. EC4115
iECH74115_1262
icit_c
Escherichia coli HS
iEcHS_1320
icit_c
Escherichia coli IAI1
iECIAI1_1343
icit_c
Escherichia coli IAI39
iECIAI39_1322
icit_c
Escherichia coli NA114
iECNA114_1301
icit_c
Escherichia coli O103:H2 str. 12009
iECO103_1326
icit_c
Escherichia coli O111:H- str. 11128
iECO111_1330
icit_c
Escherichia coli O26:H11 str. 11368
iECO26_1355
icit_c
Escherichia coli IHE3034
iECOK1_1307
icit_c
Escherichia coli ATCC 8739
iEcolC_1368
icit_c
Escherichia coli 536
iECP_1309
icit_c
Escherichia coli S88
iECS88_1305
icit_c
Escherichia coli O157:H7 str. Sakai
iECs_1301
icit_c
Escherichia coli SE11
iECSE_1348
icit_c
Escherichia coli SE15
iECSF_1327
icit_c
Escherichia coli SMS-3-5
iEcSMS35_1347
icit_c
Escherichia coli O157:H7 str. TW14359
iECSP_1301
icit_c
Escherichia coli UMN026
iECUMN_1333
icit_c
Escherichia coli W
iECW_1372
icit_c
Escherichia coli KO11FL
iEKO11_1354
icit_c
Escherichia coli ETEC H10407
iETEC_1333
icit_c
Escherichia coli O55:H7 str. CB9615
iG2583_1286
icit_c
Escherichia coli LF82
iLF82_1304
icit_c
Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C
iNRG857_1313
icit_c
Shigella flexneri 2a str. 2457T
iS_1188
icit_c
Shigella boydii CDC 3083-94
iSbBS512_1146
icit_c
Shigella boydii Sb227
iSBO_1134
icit_c
Shigella dysenteriae Sd197
iSDY_1059
icit_c
Shigella flexneri 5 str. 8401
iSFV_1184
icit_c
Shigella flexneri 2002017
iSFxv_1172
icit_c
Shigella sonnei Ss046
iSSON_1240
icit_c
Escherichia coli UM146
iUMN146_1321
icit_c
Escherichia coli UMNK88
iUMNK88_1353
icit_c
Escherichia coli UTI89
iUTI89_1310
icit_c
Escherichia coli W
iWFL_1372
icit_c
Escherichia coli O157:H7 str. EDL933
iZ_1308
icit_c
Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655
iJR904
icit_c
Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655
e_coli_core
icit_c
Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578
iYL1228
icit_c
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2
STM_v1_0
icit_c
Geobacter metallireducens GS-15
iAF987
icit_c
Synechocystis sp. PCC 6803
iJN678
icit_c
Mus musculus
iMM1415
icit_c
Methanosarcina barkeri str. Fusaro
iAF692
icit_c
Thermotoga maritima MSB8
iLJ478
icit_c
Clostridium ljungdahlii DSM 13528
iHN637
icit_c
Chlamydomonas reinhardtii
iRC1080
icit_c
Escherichia coli str. K-12 substr. W3110
iY75_1357
icit_c
Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168
iYO844
icit_c
Homo sapiens
RECON1
icit_c
Homo sapiens
iAT_PLT_636
icit_c
Homo sapiens
iAB_RBC_283
icit_c
Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655
iAF1260b
icit_c
Cricetulus griseus
iCHOv1
icit_c
Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363
iNF517
icit_c
Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655
iML1515
icit_c
Synechococcus elongatus PCC 7942
iJB785
icit_c
Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1
iLB1027_lipid
icit_c
Homo sapiens
Recon3D
icit_c
Mycobacterium tuberculosis H37Rv
iEK1008
icit_c
Cricetulus griseus
iCHOv1_DG44
icit_c
Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516
iYS854
icit_c
Escherichia coli BL21(DE3)
iEC1356_Bl21DE3
icit_c
Escherichia coli ATCC 8739
iEC1349_Crooks
icit_c
Escherichia coli W
iEC1364_W
icit_c
Escherichia coli str. K-12 substr. W3110
iEC1372_W3110
icit_c
Acinetobacter baumannii AYE
iCN718
icit_c
Escherichia coli DH5[alpha]
iEC1368_DH5a
icit_c
Escherichia coli C
iEC1344_C
icit_c
Synechocystis sp. PCC 6803
iSynCJ816
icit_c
Plasmodium falciparum 3D7
iAM_Pf480
icit_c
Plasmodium vivax Sal-1
iAM_Pv461
icit_c
Plasmodium berghei
iAM_Pb448
icit_c
Plasmodium cynomolgi strain B
iAM_Pc455
icit_c
Plasmodium knowlesi strain H
iAM_Pk459
icit_c
Clostridioides difficile 630
iCN900
icit_c
Pseudomonas putida KT2440
iJN1463
icit_c
Salmonella pan-reactome
iYS1720
icit_c
Escherichia coli APEC O1
iAPECO1_1312
icit_e
Shigella flexneri 2a str. 301
iSF_1195
icit_e
Pseudomonas putida KT2440
iJN746
icit_e
Escherichia coli BW2952
iBWG_1329
icit_e
Escherichia coli BL21(DE3)
iB21_1397
icit_e
Escherichia coli CFT073
ic_1306
icit_e
Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69
iE2348C_1286
icit_e
Escherichia coli 042
iEC042_1314
icit_e
Escherichia coli 55989
iEC55989_1330
icit_e
Escherichia coli ABU 83972
iECABU_c1320
icit_e
Escherichia coli B str. REL606
iECB_1328
icit_e
Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG'
iECBD_1354
icit_e
Escherichia coli BL21(DE3)
iECD_1391
icit_e
Escherichia coli DH1
iEcDH1_1363
icit_e
Escherichia coli DH1
iECDH1ME8569_1439
icit_e
Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B
iECDH10B_1368
icit_e
Escherichia coli O139:H28 str. E24377A
iEcE24377_1341
icit_e
Escherichia coli ED1a
iECED1_1282
icit_e
Escherichia coli O157:H7 str. EC4115
iECH74115_1262
icit_e
Escherichia coli HS
iEcHS_1320
icit_e
Escherichia coli IAI1
iECIAI1_1343
icit_e
Escherichia coli IAI39
iECIAI39_1322
icit_e
Escherichia coli NA114
iECNA114_1301
icit_e
Escherichia coli O103:H2 str. 12009
iECO103_1326
icit_e
Escherichia coli O111:H- str. 11128
iECO111_1330
icit_e
Escherichia coli O26:H11 str. 11368
iECO26_1355
icit_e
Escherichia coli IHE3034
iECOK1_1307
icit_e
Escherichia coli ATCC 8739
iEcolC_1368
icit_e
Escherichia coli 536
iECP_1309
icit_e
Escherichia coli S88
iECS88_1305
icit_e
Escherichia coli O157:H7 str. Sakai
iECs_1301
icit_e
Escherichia coli SE11
iECSE_1348
icit_e
Escherichia coli SE15
iECSF_1327
icit_e
Escherichia coli SMS-3-5
iEcSMS35_1347
icit_e
Escherichia coli O157:H7 str. TW14359
iECSP_1301
icit_e
Escherichia coli UMN026
iECUMN_1333
icit_e
Escherichia coli W
iECW_1372
icit_e
Escherichia coli KO11FL
iEKO11_1354
icit_e
Escherichia coli ETEC H10407
iETEC_1333
icit_e
Escherichia coli O55:H7 str. CB9615
iG2583_1286
icit_e
Escherichia coli LF82
iLF82_1304
icit_e
Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C
iNRG857_1313
icit_e
Shigella flexneri 2a str. 2457T
iS_1188
icit_e
Shigella boydii CDC 3083-94
iSbBS512_1146
icit_e
Shigella boydii Sb227
iSBO_1134
icit_e
Shigella dysenteriae Sd197
iSDY_1059
icit_e
Shigella flexneri 5 str. 8401
iSFV_1184
icit_e
Shigella flexneri 2002017
iSFxv_1172
icit_e
Shigella sonnei Ss046
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icit_e
Escherichia coli UM146
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icit_e
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iUMNK88_1353
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iUTI89_1310
icit_e
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iWFL_1372
icit_e
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iZ_1308
icit_e
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2
STM_v1_0
icit_e
Escherichia coli str. K-12 substr. W3110
iY75_1357
icit_e
Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168
iYO844
icit_e
Homo sapiens
Recon3D
icit_e
Acinetobacter baumannii AYE
iCN718
icit_e
Pseudomonas putida KT2440
iJN1463
icit_e
Salmonella pan-reactome
iYS1720
icit_e
Escherichia coli APEC O1
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Shigella flexneri 2a str. 301
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Pseudomonas putida KT2440
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Escherichia coli BW2952
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icit_p
Escherichia coli BL21(DE3)
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icit_p
Escherichia coli CFT073
ic_1306
icit_p
Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69
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icit_p
Escherichia coli 042
iEC042_1314
icit_p
Escherichia coli 55989
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icit_p
Escherichia coli ABU 83972
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icit_p
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Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG'
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icit_p
Escherichia coli BL21(DE3)
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icit_p
Escherichia coli DH1
iEcDH1_1363
icit_p
Escherichia coli DH1
iECDH1ME8569_1439
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Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B
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Escherichia coli O139:H28 str. E24377A
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Escherichia coli ED1a
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4115
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Escherichia coli HS
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Escherichia coli S88
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Escherichia coli O157:H7 str. Sakai
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Escherichia coli SE11
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Escherichia coli SE15
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Shigella flexneri 2a str. 2457T
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Shigella boydii CDC 3083-94
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Shigella boydii Sb227
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Shigella dysenteriae Sd197
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Shigella flexneri 5 str. 8401
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Shigella flexneri 2002017
iSFxv_1172
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Shigella sonnei Ss046
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Escherichia coli UM146
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Escherichia coli UMNK88
iUMNK88_1353
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Escherichia coli UTI89
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Escherichia coli W
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Escherichia coli O157:H7 str. EDL933
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Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2
STM_v1_0
icit_p
Escherichia coli str. K-12 substr. W3110
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Pseudomonas putida KT2440
iJN1463
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Salmonella pan-reactome
iYS1720
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Saccharomyces cerevisiae S288C
iMM904
icit_m
Saccharomyces cerevisiae S288C
iND750
icit_m
Mus musculus
iMM1415
icit_m
Chlamydomonas reinhardtii
iRC1080
icit_m
Homo sapiens
RECON1
icit_m
Homo sapiens
iAT_PLT_636
icit_m
Cricetulus griseus
iCHOv1
icit_m
Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1
iLB1027_lipid
icit_m
Homo sapiens
Recon3D
icit_m
Cricetulus griseus
iCHOv1_DG44
icit_m
Plasmodium falciparum 3D7
iAM_Pf480
icit_m
Plasmodium vivax Sal-1
iAM_Pv461
icit_m
Plasmodium berghei
iAM_Pb448
icit_m
Plasmodium cynomolgi strain B
iAM_Pc455
icit_m
Plasmodium knowlesi strain H
iAM_Pk459
icit_m
Trypanosoma cruzi Dm28c
iIS312_Trypomastigote
icit_m
Trypanosoma cruzi Dm28c
iIS312_Epimastigote
icit_m
Trypanosoma cruzi Dm28c
iIS312
icit_m
Trypanosoma cruzi Dm28c
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icit_m
Saccharomyces cerevisiae S288C
iMM904
icit_x
Saccharomyces cerevisiae S288C
iND750
icit_x
Mus musculus
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icit_x
Chlamydomonas reinhardtii
iRC1080
icit_x
Homo sapiens
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icit_x
Cricetulus griseus
iCHOv1
icit_x
Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1
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icit_x
Homo sapiens
Recon3D
icit_x
Cricetulus griseus
iCHOv1_DG44
icit_x
Chlamydomonas reinhardtii
iRC1080
icit_h

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Old identifiers

    icit