Gene: ECD_RS15870

Descriptive name:

Model:

iEC1356_Bl21DE3

Position:

Left: 3197462 – Right: 3198895

Strand:

Plus

Chromosome:

NC_012971.2

DNA Sequence

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

Protein Sequence

MRFSRFIIGLTSCIAFSVQAANVDEYVTQLPAGANLALMVQKVGASAPAIDYHSQQMALPASTQKVITALAALIQLGPDFRFTTTLETKGNVENGVLKGDLVARFGADPTLKRQDIRNMVATLKKSGVNQIDGNVLIDTSIFASHDKAPGWPWNDMTQCFSAPPAAAIVDRNCFSVSLYSAQKPGDMAFIRVASYYPVTMFSQVRTLPRGSAEAQYCELDVVPGDLNRFTLTGCLPQRSEPLPLAFAVQDGASYAGAILKDELKQAGITWSGTLLRQTQVNEPGTVVASKQSAPLHDLLKIMLKKSDNMIADTVFRMIGHARFNVPGTWRAGSDAVRQILRQQAGVDIGNTIIADGSGLSRHNLIAPATMMQVLQYIAQHDNELNFISMLPLAGYDGSLQYRAGLHQAGVDGKVSAKTGSLQGVYNLAGFITTASGQRMAFVQYLSGYAVEPADQRNRRIPLVRFESRLYKDIYQNN

Associated reactions:

BiGG ID
Name
Gene reaction rule
MDDCP1pp
Murein D,D-carboxypeptidase (murein5px4p) (periplasm)
ECD_RS03040 or ECD_RS15870 or ECD_RS04340 or ECD_RS10100
MDDCP2pp
Murein D,D-carboxypeptidase (murein5px4px4p) (periplasm)
ECD_RS03040 or ECD_RS15870 or ECD_RS04340 or ECD_RS10100
MDDCP3pp
Murein D,D-carboxypeptidase (murein5p5p) (periplasm)
ECD_RS03040 or ECD_RS15870 or ECD_RS04340 or ECD_RS10100
MDDCP4pp
Murein D,D-carboxypeptidase (murein5p4p) (periplasm)
ECD_RS03040 or ECD_RS15870 or ECD_RS04340 or ECD_RS10100
MDDCP5pp
Murein D,D-carboxypeptidase (murein5p3p) (periplasm)
ECD_RS03040 or ECD_RS15870 or ECD_RS04340 or ECD_RS10100
MDDEP1pp
Murein D,D-endopeptidase (murein4px4p) (periplasm)
ECD_RS15870 or ECD_RS11680 or ECD_RS10700
MDDEP2pp
Murein D,D-endopeptidase (murein3px4p) (periplasm)
ECD_RS15870 or ECD_RS11680 or ECD_RS10700
MDDEP3pp
Murein D,D-endopeptidase (murein5px4p) (periplasm)
ECD_RS15870 or ECD_RS11680 or ECD_RS10700
MDDEP4pp
Murein D,D-endopeptidase (murein4px4px4p) (periplasm)
ECD_RS15870 or ECD_RS11680 or ECD_RS10700

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Old identifiers

    ECD_03047

Latest BiGG Models publication:

King ZA, Lu JS, Dräger A, Miller PC, Federowicz S, Lerman JA, Ebrahim A, Palsson BO, and Lewis NE. BiGG Models: A platform for integrating, standardizing, and sharing genome-scale models (2016) Nucleic Acids Research 44(D1):D515-D522. doi:10.1093/nar/gkv1049

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