Gene: ECOLC_RS05515

Descriptive name:

Model:

iEC1349_Crooks

Position:

Left: 1120678 – Right: 1122822

Strand:

Minus

Chromosome:

NC_010468.1

DNA Sequence

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

Protein Sequence

MATTTAECLTQETMDYHALNAMLNLYDSAGRIQFDKDRQAVDAFIATHVRPNSVTFSSQQQRLNWLVNEGYYDESVLNRYSRDFVITLFAHAHTSGFRFQTFLGAWKFYTSYTLKTFDGKRYLEDFADRVTMVALTLAQGDETLALQLTDEMLSGRFQPATPTFLNCGKQQRGELVSCFLLRIEDNMESIGRAVNSALQLSKRGGGVAFLLSNLREAGAPIKRIENQSSGVIPVMKMLEDAFSYANQLGARQGAGAVYLHAHHPDILRFLDTKRENADEKIRIKTLSLGVVIPDITFHLAKENAQMALFSPYDVERVYGKPFADVAISQHYDELVADERIRKKYLNARDFFQRLAEIQFESGYPYIMYEDTVNRANPIAGRINMSNLCSEILQVNSASEYDENLDYTRTGHDISCNLGSLNIAHTMDSPDFARTVETAVRGLTAVSDMSHIRSVPSIEAGNAASHAIGLGQMNLHGYLAREGIAYGSPEALDFTNLYFYAITWHALRTSMLLARERGETFAGFKQSRYASGEYFSQYLQGNWQPKTAKVGELFTRSGITLPTREMWAQLRDDVMRYGIYNQNLQAVPPTGSISYINHATSSIHPIVAKVEIRKEGKTGRVYYPAPFMTNENLALYQDAYEIGAEKIIDTYAEATRHVDQGLSLTLFFPDTATTRDINKAQIYAWRKGIKTLYYIRLRQMALEGTEIEGCVSCAL

Associated reactions:

BiGG ID
Name
Gene reaction rule
RNDR1b
Ribonucleoside-diphosphate reductase (ADP) (glutaredoxin)
(ECOLC_RS13600 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510)) or (ECOLC_RS00520 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510)) or (ECOLC_RS10620 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510)) or (ECOLC_RS14755 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510))
RNDR2b
Ribonucleoside-diphosphate reductase (GDP) (glutaredoxin)
(ECOLC_RS14755 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510)) or (ECOLC_RS00520 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510)) or (ECOLC_RS13600 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510)) or (ECOLC_RS10620 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510))
RNDR3b
Ribonucleoside-diphosphate reductase (CDP) (glutaredoxin)
(ECOLC_RS14755 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510)) or (ECOLC_RS00520 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510)) or (ECOLC_RS10620 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510)) or (ECOLC_RS13600 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510))
RNDR4b
Ribonucleoside-diphosphate reductase (UDP) (glutaredoxin)
(ECOLC_RS14755 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510)) or (ECOLC_RS13600 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510)) or (ECOLC_RS00520 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510)) or (ECOLC_RS10620 and (ECOLC_RS05515 and ECOLC_RS05510))

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Old identifiers

    EcolC_1031

Latest BiGG Models publication:

King ZA, Lu JS, Dräger A, Miller PC, Federowicz S, Lerman JA, Ebrahim A, Palsson BO, and Lewis NE. BiGG Models: A platform for integrating, standardizing, and sharing genome-scale models (2016) Nucleic Acids Research 44(D1):D515-D522. doi:10.1093/nar/gkv1049

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